Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms