Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS1

BHLHA15, Class A basic helix-loop-helix protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA15Q7RTS1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BHLHA15Q7RTS1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms