Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRINP3Q76B58 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRINP3Q76B58 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms