Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCD3Q6STE5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms