Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms