Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
WSCD1Q658N2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms