Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF123Q5XPI4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF123Q5XPI4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms