Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BROXQ5VW32 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BROXQ5VW32 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms