Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms