Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYT6Q5T7P8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms