Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC93Q567U6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms