Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LETM2Q2VYF4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LETM2Q2VYF4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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