Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MICAQ29983 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MICAQ29983 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MICAQ29983 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAQ29983 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAQ29983 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAQ29983 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAQ29983 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAQ29983 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAQ29983 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MICAQ29983 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms