Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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