Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SGCAQ16586 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCAQ16586 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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