Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RBBP7Q16576 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms