Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VPS72Q15906 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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