Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP4Q15650 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRIP4Q15650 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms