Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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