Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms