Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DNASE1L3Q13609 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms