Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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NAE1Q13564 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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NAE1Q13564 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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NAE1Q13564 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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