Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HDAC1Q13547 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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