Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATRQ13535 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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