Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AP3B2Q13367 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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