Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP140Q13342 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SP140Q13342 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP140Q13342 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP140Q13342 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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