Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXD4Q12950 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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