Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX10Q12887 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX10Q12887 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX10Q12887 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms