Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY1Q0D2K3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms