Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EP300Q09472 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EP300Q09472 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EP300Q09472 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EP300Q09472 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EP300Q09472 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EP300Q09472 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EP300Q09472 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EP300Q09472 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EP300Q09472 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms