Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NCBP1Q09161 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NCBP1Q09161 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms