Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms