Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME1Q06323 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms