Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms