Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms