Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms