Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms