Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms