Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms