Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GTF2BQ00403 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms