Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM193AP78312 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms