Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVK-24P63145 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVK-24P63145 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms