Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERVK-21P61565 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-21P61565 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms