Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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