Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFC1P60507 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFC1P60507 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms