Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms