Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EEFSECP57772 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms