Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP107P57740 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms