Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN2P57739 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms