Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNU13P55769 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNU13P55769 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNU13P55769 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms